基本上，您的计算机上安装了2个pear安装，并且“ pear upgrade”命令将更新另一个，而不是自身。
我认为您正在运行的pear版本已经通过ubuntu的apt安装了。
找出它的安装位置apt（在Debian / Ubuntu上）：
$ dpkg -L PHP-pear
...
/usr/share/PHP/PEAR.PHP
...
/usr/bin/pear
现在，让我们看看pear将文件安装到哪里：
$ pear config-get PHP_dir
/usr/share/PHP
在我的机器上，这是相同的-但可能不是在您的机器上，这就是问题所在。通过设置修复它PHP_dir，还有bin_dir：
$ pear config-set PHP_dir /usr/share/PHP
$ pear config-set bin_dir /usr/bin
，删除Ubuntu梨并从http://pear.php.net/go-pear.phar重新安装
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