with open('out.txt', 'w') as f:
print >> f, 'Filename:', filename # Python 2.x
print('Filename:', filename, file=f) # Python 3.x
但是，重定向标准输出对我也有效。像这样的一次性脚本可能很好：
import sys
orig_stdout = sys.stdout
f = open('out.txt', 'w')
sys.stdout = f
for i in range(2):
print 'i = ', i
sys.stdout = orig_stdout
f.close()
./script.py > out.txt
其他问题：
我的第一个猜测是glob找不到任何bamfile，因此for循环不会运行。检查文件夹是否存在，并在脚本中打印出bamfiles。
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清零编程群