我的服务器的管理员重新启动了Apache，这神奇地解决了这个问题。完全相同的Python文件加载而不会引起populate() isn't reentrant。我什至尝试加载语法错误的另一个文件，然后对其进行修复，服务器能够加载新文件并正常运行而没有任何问题。
我仍然不知道出了什么问题，但是由于问题已经解决，因此我将其标记为“已解决”。（好吧，只要StackOverflow允许我接受自己的答案，我就会将其标记为已回答。）
更新：当我意外上传带有语法错误的Python并继续出现此错误后，我想出了一种解决方法，比重新启动Apache更容易。当WSGI开始引发populate() isn't reentrant错误时，我wsgi.py用以下简单函数替换了Django项目：
def application(environ, start_response):
if environ['mod_wsgi.process_group'] != '':
import signal
os.kill(os.getpid(), signal.SIGINT)
return ["killed"]
然后，我重新加载我的网站，并且WSGI守护进程重新启动（即使网站仍然显示相同的500错误，我也可以通过查看Apache日志来判断）。
如果我然后wsgi.py恢复到正常状态并再次重新加载，则WSGI成功地拾取了我的代码而没有抛出populate() isn't reentrant错误（假设这次我没有语法错误）。因此，整个Apache不需要重新启动，仅需要重新启动WSGI进程，而我无需root特权就可以重新启动。
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清零编程群