（1）是的，您基本上是正确的。
该python_stubs@H_403_4@文件是 自动 生成的文件，其中包含内置函数的虚拟定义。如果未针对给定版本对内置函数进行硬编码，则PyCharm使用它来推断内置函数的类型。
（3）并非总是只能从其文档中正确推断出内置functoin的类型。一些文档字符串以“类型签名”开头：
>>> print(min.__doc__)
min(iterable[, key=func]) -> value
min(a, b, c, ...[, key=func]) -> value
@H_403_4@但是pickle.load()@H_403_4@没有。
请注意，这可能会在将来的python版本中发生变化，因为从python3.4开始引入了Argument Clinic，它可以更好地检查C语言中定义的内置函数。我不确定PyCharm是否已经能够获取该信息。
（2）尝试重建python骨架。但是，AFAIK（如果这不起作用）唯一的真实选择是在PyCharm的问题跟踪器上打开故障单。
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清零编程群