你pip很可能使用不同的python，有种你已经vtk安装使用/usr/local/bin/python，而你的pip二进制文件的用途/usr/bin/python。
检查：
$ head -n1 $(which pip)
为了解决该问题，您可以选择使用virtualenv或pip使用安装/usr/local/bin/python：
curl https://raw.github.com/pypa/pip/master/contrib/get-pip.py | /usr/local/bin/python
有关更多安装说明，请参见http://www.pip-installer.org/en/latest/installing.html
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清零编程群