我想我csr
用以下方法重新创建了行索引:
def extractor(indices, N):
indptr=np.arange(len(indices)+1)
data=np.ones(len(indices))
shape=(len(indices),N)
return sparse.csr_matrix((data,indices,indptr), shape=shape)
csr
我在周围徘徊的测试:
In [185]: M
Out[185]:
<30x40 sparse matrix of type '<class 'numpy.float64'>'
with 76 stored elements in Compressed Sparse Row format>
In [186]: indices=np.r_[0:20]
In [187]: M[indices,:]
Out[187]:
<20x40 sparse matrix of type '<class 'numpy.float64'>'
with 57 stored elements in Compressed Sparse Row format>
In [188]: extractor(indices, M.shape[0])*M
Out[188]:
<20x40 sparse matrix of type '<class 'numpy.float64'>'
with 57 stored elements in Compressed Sparse Row format>
与许多其他csr
方法一样,它使用矩阵乘法来产生最终值。在这种情况下,所选行中的稀疏矩阵为1。时间实际上好一点。
In [189]: timeit M[indices,:]
1000 loops, best of 3: 515 µs per loop
In [190]: timeit extractor(indices, M.shape[0])*M
1000 loops, best of 3: 399 µs per loop
在您的情况下,提取器矩阵的形状为(len(train_indices),347),只有len(training_indices)
值。所以不大。
但是,如果amatrix
太大(或至少第二维那么大),从而在矩阵乘法例程中产生一些错误,则可能会导致分段错误而没有python / numpy捕获它。
确实matrix.sum(axis=1)
有效。尽管使用了1s的密集矩阵,但它也使用了矩阵乘法。或者sparse.eye(347)*M
,类似的大小矩阵乘法?