从命令行一遍又一遍地运行Clojure脚本不是惯用的。REPL是更好的命令行。Clojure是一个Lisp，通常会启动Clojure并使该实例永远运行，并与其交互而不是重新启动它。您可以一次更改一个正在运行的实例中的功能，然后运行它们并根据需要戳它们。摆脱繁琐而缓慢的传统编辑/编译/调试周期是Lisps的一大特色。
您可以轻松编写函数来执行诸如运行单元测试之类的功能，并且只要想运行它们就可以从REPL调用这些函数，否则就忽略它们。在Clojure中clojure.contrib.test- is，通常会使用，将测试函数添加到名称空间中，然后再使用clojure.contrib.test-is/run-tests它们来运行它们。
不从命令行运行Clojure的另一个很好的理由是，JVM的启动时间可能过长。
如果您真的想从命令行运行Clojure脚本，则可以使用多种方法。有关某些讨论，请参见Clojure邮件列表。
一种方法是测试命令行参数的存在。foo.clj在当前目录中给出以下内容：
(ns foo)
(defn hello [x] (println "Hello," x))
(if *command-line-args*
(hello "command line")
(hello "REPL"))
根据如何启动Clojure，您将获得不同的行为。
$ java -cp ~/path/to/clojure.jar:. clojure.main foo.clj --
Hello, command line
$ java -cp ~/path/to/clojure.jar:. clojure.main
Clojure 1.1.0-alpha-SNAPSHOT
user=> (use 'foo)
Hello, REPL
nil
user=>
见src/clj/clojure/main.clj在Clojure的来源，如果你想看到这是如何工作的。
另一种方法是将代码编译成.class文件，然后从Java命令行调用它们。给定一个源文件foo.clj：
(ns foo
(:gen-class))
(defn hello [x] (println "Hello," x))
(defn -main [] (hello "command line"))
创建一个目录来存储编译的.class文件；默认为./classes。您必须自己创建此文件夹，Clojure不会创建它。还要确保您设置$CLASSPATH为包括./classes和带有源代码的目录；我假设foo.clj它在当前目录中。因此，从命令行：
$ mkdir classes
$ java -cp ~/path/to/clojure.jar:./classes:. clojure.main
Clojure 1.1.0-alpha-SNAPSHOT
user=> (compile 'foo)
foo
在classes目录中，您现在将有一堆.class文件。要从命令行调用代码（-main默认情况下运行函数）：
$ java -cp ~/path/to/clojure.jar:./classes foo
Hello, command line.
clojure.org上有很多有关编译Clojure代码的信息。
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清零编程群