如您的注释所述，如果您运行 相同的命令， 则命令提示符和使用Pythonsubprocess模块都会产生相同的结果（0退出代码）。
您可能会看到不同的退出代码，因为您使用了 不同的 命令。毫不奇怪。Pythonsubprocess模块返回正确的（对于给定命令）退出代码。
如果它没有返回正确的退出状态，那么您可以& exit在cmd.exe命令的末尾添加作为获取正确返回代码的解决方法，请参阅Python问题上的“ Windows子进程：shell = True的错误返回代码”追踪器：
from subprocess import check_call
check_call(r'C:\path\to\runsikuli.cmd -r C:\path\to\sikuli-script.sikuli & exit',
shell=True)
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